记者了解到，神舟十六号载人飞船本次将携带实验载荷300公斤左右。“本次载荷包含4个领域，分别为航天医学、空间技术应用、航天技术实验、特殊实验领域。”中国航天科技集团五院载人飞船系统总体主任设计师高旭介绍，本次的载荷特色在于载人飞船在待发阶段还能安装少量实验载荷，这非常有利于时效性要求较高的实验载荷，可以更高效地开展后续科学实验。
记者了解到，本次神舟十六号载人飞船船箭分离后将采用快速交会对接模式上行，最终对接于“天和”核心舱径向端口。这次对接和以往有何不同？高旭表示，神舟十三号载人飞船发射时就采用了径向端口对接，神舟十四号载人飞船是第二次采用径向端口对接，本次对接与前两次的显著区别在于目标质量明显变大。“这次对接的目标是超百吨的t字型中国空间站，8吨级的载人飞船和空间站组合体垂直对接的难度在于对接缓冲的控制和传感器的遮挡识别压黏系数，具备一定挑战性。”
不过早在神舟十二号载人飞船发射时，设计团队就做出了全面充足的考虑。“从神舟十二号载人飞船设计开始，我们就面向整个空间站任务的所有端口对接工况上齿面，针对不同方向和不同对接目标做了大量的仿真和地面试验，经过充分验证，因此本次径向对接任务充满信心。”高旭说。
神舟十六号载人飞船发射后，神舟十五号载人飞船也将返回。本次返回有什么特点？高旭表示，神舟十五号载人飞船的返回依旧采用5圈快速返回模式，该模式从神舟十三号开始进行优化，时间为7.5小时左右，加上从空间站分离到规范分离，总返回时间为8小时左右。“相比神舟十二号的两天返回模式，5圈快递返回模式改善了航天员的旅途疲劳性和舒适性。此外，飞船拥有50公斤左右的下行载荷能力，下行的过程越短，有时效性需要冷藏环境的实验样品就可以快速回到地面进行后续分析工作。”